dcm2niiを用いてDICOM形式をNIFTI形式へ変換する方法

しばらく前ですが、dcm2niiを用いてDICOM形式をNIFTI形式に変換する方法についてドキュメントを作成しました。ブログ形式で改めて公開します。

サンプルのDICOM画像として、1例分準備しました。こちらのDICOM画像で説明していますので、理解を深めたい方はこちら(T1.zip)からダウンロードして試してみてください。

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pipを用いたUbuntuへのANTsのインストール方法(ソースコードからのコンパイル)

しばらく前に、ANTsのUbuntu 14.04へのインストール方法(ソースからのコンパイル)という記事を書きましたが、最近のANTsは、cmakeのバージョンが3.10以上でないとコンパイルできなくなっていました。

方法を探してみましたが、cmakeのコンパイルを説明するページが圧倒的でした。
しかし、さらに探していたところ、pipを使えばすんなりいくことがわかりました。

pipは、pythonのパッケージ管理システムで、この中にcmakeも入っています。

ということで、改めて記事を書いていきます。

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Unbelievable accident

The other day the Web-hosting service provider I rent a server lost all of my data on the server I rent. It’s unbelievable…

It’s no use crying over the accident, so I restart the blog.

I will recover the contents of the blog as much as possible from now on.