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FSLのJHU-labels.xml から、sed を使って領域名だけを抽出する方法

FSLには Johns Hopkins University の白質アトラスがついてきます。
そのアトラスの領域名を抽出したいと思いました。

Short answer

cat JHU-labels.xml |\
sed -e 's@<label.*">@@' \
    -e 's@</label>@@' \
    -e 's@ @_@g' -e 's@__@@' |\
sed -n 17,66p

で、以下のようになります。

Middle_cerebellar_peduncle
Pontine_crossing_tract_(a_part_of_MCP)
Genu_of_corpus_callosum
Body_of_corpus_callosum
Splenium_of_corpus_callosum
...

もし、アトラスの番号を振りたかったら以下のようにします。

cat JHU-labels.xml |\
sed -e 's@<label.*">@@' \
    -e 's@</label>@@' \
    -e 's@ @_@g' \
    -e 's@__@@' |\
sed -n 17,66p |\
nl -n rz |
sed -E 's@0{4}@@'

この結果は以下になります。

01  Middle_cerebellar_peduncle
02  Pontine_crossing_tract_(a_part_of_MCP)
03  Genu_of_corpus_callosum
04  Body_of_corpus_callosum
05  Splenium_of_corpus_callosum
...

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