FSLには Johns Hopkins University の白質アトラスがついてきます。
そのアトラスの領域名を抽出したいと思いました。
Short answer
cat JHU-labels.xml |\
sed -e 's@<label.*">@@' \
-e 's@</label>@@' \
-e 's@ @_@g' -e 's@__@@' |\
sed -n 17,66p
で、以下のようになります。
Middle_cerebellar_peduncle Pontine_crossing_tract_(a_part_of_MCP) Genu_of_corpus_callosum Body_of_corpus_callosum Splenium_of_corpus_callosum ...
もし、アトラスの番号を振りたかったら以下のようにします。
cat JHU-labels.xml |\
sed -e 's@<label.*">@@' \
-e 's@</label>@@' \
-e 's@ @_@g' \
-e 's@__@@' |\
sed -n 17,66p |\
nl -n rz |
sed -E 's@0{4}@@'
この結果は以下になります。
01 Middle_cerebellar_peduncle 02 Pontine_crossing_tract_(a_part_of_MCP) 03 Genu_of_corpus_callosum 04 Body_of_corpus_callosum 05 Splenium_of_corpus_callosum ...