CONNを試したいけれどもデータがないという方のためにデータを準備しました。
COBREデータセットから、30代の健常者と統合失調症患者をそれぞれ10例ずつ集めてあります。
データはこちらからダウンロードしてください。500MB強あります。
ZIPファイルをダウンロードし、展開すると、そこにsampleフォルダがあります。
また、subjects.txtもあります。後ほど使います。
このsampleフォルダを先ほど作成したconn_practiceの下に置いてください。
CONNを試したいけれどもデータがないという方のためにデータを準備しました。
COBREデータセットから、30代の健常者と統合失調症患者をそれぞれ10例ずつ集めてあります。
データはこちらからダウンロードしてください。500MB強あります。
ZIPファイルをダウンロードし、展開すると、そこにsampleフォルダがあります。
また、subjects.txtもあります。後ほど使います。
このsampleフォルダを先ほど作成したconn_practiceの下に置いてください。
貴重なチュートリアルをありがとうございます。CONNの使い方を勉強しようと思っておりましたので、大変感謝しております。こちらのデータでチュートリアル14まで同様の操作ができたので、手持ちのrsfMRIデータ(まだ1例しかありませんが)でも同様にできるかなと思いやろうと思ったのですが、根本的なデータ処理が違うのか、さっそくつまづいてしまいました。私のデータは400multisliceのデータでして、dcm2niiでSPM8(3D NIfTi nii)でniiに変換し400個のniiファイルに変換となっています。先生のデータをMRIcronで開こうとしても開けないようですが、データ形式が違うのでしょうか?初歩的な質問で申し訳ありません。ご教授ください。
ご質問の事柄に関しては、4次元データセットに変えていただくことがいいと思います。
今のSPM8のデータセットは3次元データセットですが、一つのファイルに第4次元として、時系列を考えることで
ひとつのデータセットにできます。
dcm2niiのGUI版ではメニューにNIfTI 3D -> 4D というものがありますので、
それを用いて4次元データに変えたものを使われてみてはいかがでしょうか?
遅くなり申し訳ありません。4Dに変更しCONNにデータを認識させることができました。少しずつ使えるように勉強していきます。
ありがとうございました。
無事にできてよかったです。
おもしろいソフトなのでどうぞいろいろ学んでみてください。