FreeSurfer では Local Gyrification Index (LGI) を求めることができます。LGIを一言で言えば、脳の皮質の折りたたみの状態を指標化とでも言えるでしょうか。
詳細は、本家のウェブサイトにありますが、ポイントを示します。
- 必要なソフトウェアとしては、Matlab と Matlab Imaging Toolbox が必要となります。
- Matlab のパスに $FREESURFER_HOME/matlab を追加しておくことが必要です。
- 画像の準備としては、recon-all が終わっていることが必要です。
この3つを準備しておけば、あとは、以下のコマンドをタイプするだけです。
recon-all -s <fsid> -localGI