SETUP – Basic
Basicでは、被験者数、session数、Repetition Timeを設定します。
- Number of subjects はサンプルデータでは20例になりますので、20 と入力し、Enterを押します。そうすると、Number of sessions or runs, Repetition Time が自動で20例分入ります。
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Number of sessions or runs は、タスクfMRIやrs-fMRIを数セッション撮像している場合には変更します。サンプルデータは1セッションしか撮像していませんので、このままで大丈夫です。
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Repetition Time は、サンプルデータは 2s ですので、このままでOKです。もし、2.5s ならば、ここのところに、以下のようにタイプするといいでしょう。
ones(1,20)*2.5
ones(1,20)で1が20列並んだ行列が入力できます。それに2.5をかけているので、2.5が20並ぶ行列が作成されることになります。
- Acquisition type はデフォルトのContinuousで大丈夫です。もし、手持ちのデータがsparse sampling であれば、Sparse を選ぶことになります。（sparse samplingは、音刺激などを与えたい場合に、MRIの撮像ノイズが入るとコンタミネーションが起こるため、ノイズが出ない時間をもうける撮像法になります）
SETUP – Structural
Structuralでは、構造画像を指定します。ここで、ちょっとしたTipsがあります。
- 画像は、フィルタを上手につかって、Findで見つけます。
- Subjectsを全例選んでから、Importすることで、一気に指定することができます。
百聞は一見に如かずですので、方法を説明します。
まず、今回の画像は、構造画像はすべて Vではじまります。V*.nii とあらわすことができます。
これをCONNの右側の画面で行います。アニメーションGIFを作成してみました。
こうすると、リストにVからはじまるファイルだけ選ばれたことがわかるかと思います。
そしてこれを各Subjectに割り当てていきます。こちらも下のアニメーションGIFをご覧ください。（クリックすると拡大できます）
- まず、画面中央の Subjects をすべて選びます。Shiftを押してSubject 20を選べば全部選べます。
- 次に、先程フィルタで抽出したV*.niiもすべて選びます。20filesであることを確認して、Importをクリックします。
- 20 Files assigned to 20 Subjects と出れば正しく設定したことになります。
- その後、Subject 1から順に画像が指定されたことを確認します。
これで構造画像の指定は終わりです。
SETUP – Functional
Functionalでは、fMRI画像を指定します。これも先程と同様の方法でできます。
サンプルデータは、fMRI画像は F ではじまりますので、F*.nii で表すことができます。
これもstructuralと同一の方法でできます。アニメーションGIFで示します。（クリックすると拡大できます）
これでデータを指定することができました。
