Thinkpad X250でUbuntu 14.04を動かすときに、タッチパッドを無効にする方法

私は、今、Thinkpad X250とT430を使っています。Thinkpad T430では、BIOSで、タッチパッドを無効にすれば、そのままタッチパッドが無効になったので、よかったのですが、同じことをX250でやっても効果がありません。

それでいろいろ調べてみました。

結論は、以下の方法が一番早いかと思います。

ターミナルで以下をタイプします。

$ synclient TouchpadOff=1

ただ、これは、一時的なもので、ずっとそうしたくない場合は、自動でこれが動くようにしてあげればいいわけです。

私はXFCE環境なので、XFCEでどうするかを調べました。

2つのファイルを準備する必要があります。

  • disable-touchpad.sh (名前はなんでもいいです)
  • これには、以下の2行だけ記載されています。

    #!/bin/sh
    synclient TouchpadOff=1
    

    これを実行権限をつけた後、パスの通っているディレクトリに保存します。私は、~/binに起きました。

  • disable-touchpad.desktop (これも拡張子が.desktopであれば名前はなんでもいいです)
  • これには、以下の3行だけ記載されています。

    [Desktop Entry]
    Type=Application
    Exec=disable-touchpad.sh
    

    この保存場所が大事なのですが、

    ~/.config/autostart

    に保存します。autostartがなければ自分で作れば大丈夫です。

    これで、ログアウトし、再度ログインすると、めでたく、Touchpadが無効になっています。

ちなみに、検索するとよく出てくる

/usr/share/X11/xorg.conf.d/50-synaptics.conf

の一番最後に、以下を記載

Section "InputClass"
Identifier "no need for accelerometers in X"
MatchProduct "SynPS/2 Synaptics TouchPad"
Option "Ignore" "on"
EndSection

というのは、ひとつ間違えるとシステムが起動しなくなることもあり得るので、注意が必要です。

UbuntuへのConnectome mapperのインストール方法

Connectomeに関心が集まっている昨今、様々なソフトウェアが発表されています。
 それらの中にConnectome Mapping Toolkitがあります。Connectome Mapperがその根幹をなすものですが、Connectome mapperを動かすためには、

  • Diffusion Toolkit
  • Freesurfer
  • FSL
  • MRTrix
  • Camino
  • Camino-Trackvis
  • MITK
  • Nipype

を事前に準備しなくてはならず、そのうえでConnectome mapperを入れないといけません。

結構大変な作業です。

順天堂放射線科の神谷先生と情報交換をしながら、Ubuntuにこれらのソフトをいれ、Connectome mapperを起動させる手順書を作成しました。

悩んでいる人は試してみる価値があると思いますので、試してみてください。

PDFはこちらからダウンロードできます。

なお、Lin4Neuroの最新版(20140313)には、FreesurferとDiffusion Toolkitを除くこれらのソフトのすべてが入っています。めんどくさがりの方は、最新版のLin4Neuroを使用することをおすすめします。

Make battery-life of Ubuntu 12.04 longer on ThinkPad T430s

It’s been months since I swithed completely to Xubuntu 12.04 from MS Windows on my ThinkPad T430s. Basically I’m satisfied with Xubuntu 12.04, but there are some points which need tweaks. They are…

  • Battery Life
  • Somehow battery on ThinkPad T430s lasts only around 2hours on Xubuntu, which is much shorter than Windows.

  • Projector
  • XFCE is not so good at dealing with projectors or external monitors. I’m still struggling with this matter, so I don’t make any comments now.

As of battery life, I found a very good tool, which is TLP.

By installing TLP, the battery life gets longer by one hour without any modification, which is great.

You can find how to install TLP here.

Thinkpad T430sでUbuntu 12.04ファミリーがフリーズする時

Thinkpad T430sにXubuntu 12.04を入れました。インストール自体は何の問題もなかったのですが、入れてから1日の間に10回以上システムがフリーズしました。マウスもキーボードも何の操作も受け付けなくなってしまうのです。

これでは、信頼できないマシンになってしまいます…。

いろいろ調べたところ、カーネルを3.4にアップデートしたところ、問題が解決したという記事をみつけました。

実際にやってみました。

  1. http://kernel.ubuntu.com/~kernel-ppa/mainline/v3.4-precise/にアクセスします。
  2. 64bitの場合ここから3つのファイルをダウンロードします。
    • linux-headers-3.4.0-030400-generic_3.4.0-030400.201205210521_amd64.deb
    • linux-headers-3.4.0-030400_3.4.0-030400.201205210521_all.deb
    • linux-image-3.4.0-030400-generic_3.4.0-030400.201205210521_amd64.deb

    つまり、後ろにamd64.debとあるものとall.debとあるものです。32bitの場合でしたらi386.debとall.debになります。

  3. ダウンロードしたあとで、次のコマンドでカーネルをインストールします。

    sudo dpkg -i linux-*

  4. カーネルがインストールされたあと、古いカーネルを削除します。そのためには、apt-get autoremoveがよいと思います。
    sudo apt-get update
    sudo apt-get upgrade
    sudo apt-get autoremove
  5. マシンを再起動します。
  6. ターミナルを立ち上げ、次のようにタイプします。

    uname -r

    これで3.4.0-030400-genericと表示されれば新しいカーネルになったことを確認できます。

こうしたところ、私のThinkpad T430sは全くフリーズしなくなりました。カーネルの問題だったということですね。これで安心して解析ができます。

How to install FSL on Ubuntu

If you use Debian or Ubuntu, you can install FSL easily using neurodebian repository.
Below is what you need to install FSL.

  1. Add the neurodebian repository
  2. Follow the guideline described here.

  3. update the sources.list
  4. $ sudo apt-get update

  5. install FSL (and related packages)
  6. $ sudo apt-get install fsl fsl-doc fslview fslview-doc fsl-atlases fsl-possum-data fsl-first-data fsl-feeds dicomnifti libvtk5-dev vtk-examples vtk-doc

  7. Add the following line to .bashrc
  8. This is the thing people often forget. Without this, you can’t run fsl from shell.

    . /etc/fsl/fsl.sh

    That’s it.

Installing N3 (mni-n3) on Ubuntu 10.04 (Lucid Lynx) 64bit

Note: This article is pretty old. Now you can install MINC toolkit more easily. Please see the instruction in http://www.bic.mni.mcgill.ca/ServicesSoftware/ServicesSoftwareMincToolKit. (24 Oct 2014)

We have few resources how to install N3 on Ubuntu. I could successfully install N3 (aka mni-n3) on Ubuntu 10.04. I write down what I did.

NB: This is only for 64bit Ubuntu 10.04. They don’t maintain 32bit binary for minc.
The following commands must be executed with root privileges (use sudo) except for the last one.

  1. Add the repository for minc-related software to your /etc/apt/sources.list.
  2. You can do this by adding the following line to the /etc/apt/sources.list.

    #MINC software
    deb http://packages.bic.mni.mcgill.ca/ubuntu-lucid/ ./

    Note: You have to include “./” at the end of the line.

  3. Refresh repository
  4. $ sudo apt-get update

  5. Install N3
  6. Through many trials and errors, I found out that we have to specify the following 4 packages; minc, minc-tools, n3, and libmni-perllib-perl to have n3 work properly. Of course you can install other packages such as mni-autoreg, register, display, or mincblob. (However, I haven’t fully tested about these packages.)

    $ sudo apt-get install libmni-perllib-perl minc minc-tools n3

    Note: Ignore the Warning: “The following packages cannot be authenticated!” and press Y when asked: “Install these packages without verification [y/N]?”

  7. Configure the path
  8. Add the phrase “export PATH=/usr/local/bic/bin:$PATH” in your .bashrc file (located in your home directory). You don’t have to be root doing this.

Now you are ready to use N3 on your Ubuntu 10.04!