Note on Bounding Box

Here I have an MRI data with the following parameters;


Vox dim: 91 109 91
Vox size: 2x2x2 mm
Origin: 46 64 37

Now I want to change the image into this;


Vox dim: 157 189 156
Vox size: 1x1x1 mm
Origin: 79 113 71

How can we set the Bounding Box?
As a result of trial and error, I got this.


[-78 -112 -70; 78 76 85]

Simple way to calculate this is the following;


Vox dim – Origin = positive value.

  • 157-79=78 <– positive value in X
  • 189-113=76 <– positive value in Y
  • 156-71=85 <– positive value in Z


-(Vox dim – positive value -1) = negative value

  • -(157-78-1)=-78 <– negative value in X
  • -(189-76-1)=-112 <– negative value in Y
  • -(156-85-1)=-70 <– negative value in Z

誰も教えてくれないBounding Boxの話

画像解析をするとBounding Boxという言葉にぶつかる。 Bounding Boxは何か?と調べると、

画像データをResliceするときの範囲。

なんて表現は見つかるが、それ以外に見つからない。 さらに、SPMなどでは、Bounding Boxの設定の項目を見ると、

-90:90 -126:90 -72:108

なんて表現にぶつかる一方で、

-90 -126 -72; 90 90 108

なんて表現にもぶつかったりする。 で、いろいろ考えてみたらたいしたことはなかった。 画像の中心を[0, 0, 0]と仮定したとき、画像がx, y, z軸方向にどれだけあるのかという情報なのだ。

つまり、-90:90 -126:90 -72:108は、

x軸は中心から左右ともに90まで、y軸は前方には90、後方に126、z軸は上方に108、下方に72の範囲で画像がありますよ

ということ。 ちょっとすっきり。