Download Lin4Neuro

English

Since Lin4Neuro is pretty large around 3.0GB, some experience download failure. I recommend using downloader such as DownThemAll (Firefox plugin). Please Click the below link what you want.

You can download the latest version of Lin4Neuro from here.

Japanese

Lin4Neuro日本語版はファイルサイズが3.0GB近くと大きいため、これまでうまくダウンロードできないという報告を複数いただいています。サーバーを変えましたので、エラーは少なくなると思いますが、FirefoxのアドオンのDownThemAllのようなダウンローダーを使ってダウンロードしていただくことをおすすめします。

Lin4Neuroの最新版は こちら からダウンロードできます。

6 thoughts on “Download Lin4Neuro

  1. 根本先生
    走りました、、、、、、ありがとうございます。
    Rのigraphのインストールと python-rpy2のインストールが行われておりませんでした。

    重ねて感謝申し上げます。

    吉田正樹

    • 吉田先生

      すみません、コメントを見るのが遅くなりました。
      無事に走ったようでよかったです。

  2. 根本先生
    たびたびお世話になります。
    Connectome Analyzerをwebサイトの案内でubuntu12.04にインストールしようと試行錯誤しているのですが、Rとの設定がubuntu11の時の説明のようでうまく行きません。
    先生のLIN4Neuroを拝見すると12.04に対応されていてConnectome Analyzerが走るとのこと。
    一方、connectome mapperはすでにご指導いただき小生のubuntuには入っていて重複してしまいます。なにか、選択的にインストールする方法はないでしょうか?
    また力技で、先生のLin4Neuroをインストールするとなにかコンフリクトのようなものは起こらないでしょうか?
    教えていただければ幸いです。

    東急病院眼科
    吉田正樹

    • 吉田先生

      以下を試していただけたらと思います。

      1) Rのインストール
      a) sources.listにRのミラーサイトを追加(例:下記)

      $ sudo gedit /etc/apt/sources.list

      以下を追加

      deb http://cran.ism.ac.jp/bin/linux/ubuntu precise/

      b) Ubuntu レポジトリの公開鍵を入手

      $ gpg --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-key E084DAB9
      $ gpg -a --export E084DAB9 | sudo apt-key add -

      c) 最新のパッケージリストを取得し、Rをインストール

      $ sudo apt-get update
      $ sudo apt-get install r-base
      $ sudo apt-get install r-cran-*

      d) build-essentialsをインストール

      $ sudo apt-get install build-essential

      e) Rを起動し、igraph Libraryをインストール

      $ sudo R
      (Rの画面から以下をタイプ)
      > install.packages("igraph")

      2) Connectome Analyzerのダウンロード

      以下からConnectome Analyzerをダウンロード
      http://www.cmtk.org/analyzer/download.html

      3) python-rpy2をインストール
      (python-traitsとpypython-traitsguiは既にインストールされている)

      $ sudo apt-get install python-rpy2

      4) Connectome Analyzerをインストール

      $ sudo cp CMA_v1.0.0.tar.gz /usr/local
      $ cd /usr/local/
      $ sudo tar xvzf CMA_v1.0.0.tar.gz

      5) 設定ファイル.bashrcに記載

      以下を.bashrcに記載

      # Configuration for The Connectome Analyzer
      export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/lib/R/lib
      export R_HOME=/usr/lib/R
      export ConnectomeAnalyzerPath=/usr/local/analyzer/CMA_v1.0.0/Rfiles

      6) Connectome analyzerを実行

      $ /usr/local/analyzer/CMA_v1.0.0/run_cma

  3. ピングバック: Update of Lin4Neuro (17 May 2013)

  4. ピングバック: Update of Lin4Neuro (28 Feb 2013)

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