Xubuntu 12.04からJBL FlipをBluetoothで接続しようとしたところ、すぐにはつながりませんでした。
ググったところ、このサイトが参考になりました。
pulseaudio-module-bluetoothがキモでした。
sudo apt-get install pulseaudio-module-bluetooth
これでPulseaudioの設定で音がきちんと出るようになりました。
月別アーカイブ： 12月 2013
VBM8の前処理のベンチマーク
VBMの前処理にはどのくらいの時間がかかりますか？という質問を受けましたので、様々なマシンで計測してみました。
3人の3D-T1 MRI画像（ボクセルサイズ 1x1x1mm）をVBM8でDARTELでノーマライズしています。
前処理の設定をvbm8_preproc.matという名前で保存して、以下のベンチマークスクリプトを用意しました。とても単純なMATLABのスクリプトで、処理の前後にtic, tocというコマンドを入れることで前処理にかかった時間を測定するというものです。
%vbm8_benchmark.m
tic
spm('defaults','pet');
spm_jobman('initcfg');
load vbm8_preproc.mat;
spm_jobman('run',matlabbatch);
toc
その結果は、以下のようになりました。
| Machine | CPU | Core | Thread | Memory | OS | Matlab | Processed time |
| Workstation BTO | AMD Opteron Processor 2425HE x 2 | 12 | 12 | 24GB | Xubuntu 12.04 | R2013b | 74m31s |
| Desktop BTO | Core i7-960 3.2GHz | 4 | 8 | 24GB | Xubuntu 12.04 | R2011b | 34m47s |
| Desktop BTO | Core i7-960 3.2GHz | 4 | 8 | 24GB | Xubuntu 12.04 | R2013b | 33m20s |
| Mac Book Pro (Late 2011) | Core i7-2640M 2.8GHz | 2 | 4 | 8GB | Mac OSX 10.9 | R2011b | 30m29s |
| Thinkpad T430s | Core i7-3520M 2.9GHz | 2 | 4 | 16GB | Windows 7 | R2013a | 35m0s |
| Thinkpad T430s | Core i7-3520M 2.9GHz | 2 | 4 | 16GB | Xubuntu 12.04 | R2013b | 29m12s |
| Desktop BTO | Core i7-3930K 3.2GHz | 6 | 12 | 32GB | Xubuntu 12.04 | R2013b | 26m52s |
この結果をまとめると、以下のようになります。
- CPUが一番影響します。新しいCPU、かつ1コアあたりの性能が高いCPUだとよい結果となります。
- これはSPM全体に言えることですが、マルチコアは効果はたいしてありません。逆に言えば、SPMを複数立ち上げて処理させることで処理時間を短縮できる可能性があります。
- メモリは8GB以上あれば、さほど変わりありません。
- WindowsとLinuxを比べるとLinuxに軍配があがります。
- Matlabもバージョンが最新の方が処理速度が改善されているようです。
ということで、SPM-VBMという観点からでは、1コアあたりの周波数ができるだけ速いCPUを入手することをお勧めします。
Thinkpad T430sでUbuntu 12.04ファミリーがフリーズする時
Thinkpad T430sにXubuntu 12.04を入れました。インストール自体は何の問題もなかったのですが、入れてから1日の間に10回以上システムがフリーズしました。マウスもキーボードも何の操作も受け付けなくなってしまうのです。
これでは、信頼できないマシンになってしまいます…。
いろいろ調べたところ、カーネルを3.4にアップデートしたところ、問題が解決したという記事をみつけました。
実際にやってみました。
- http://kernel.ubuntu.com/~kernel-ppa/mainline/v3.4-precise/にアクセスします。
- 64bitの場合ここから3つのファイルをダウンロードします。
- linux-headers-3.4.0-030400-generic_3.4.0-030400.201205210521_amd64.deb
- linux-headers-3.4.0-030400_3.4.0-030400.201205210521_all.deb
- linux-image-3.4.0-030400-generic_3.4.0-030400.201205210521_amd64.deb
つまり、後ろにamd64.debとあるものとall.debとあるものです。32bitの場合でしたらi386.debとall.debになります。
- ダウンロードしたあとで、次のコマンドでカーネルをインストールします。
sudo dpkg -i linux-*
- カーネルがインストールされたあと、古いカーネルを削除します。そのためには、apt-get autoremoveがよいと思います。
sudo apt-get update sudo apt-get upgrade sudo apt-get autoremove
- マシンを再起動します。
- ターミナルを立ち上げ、次のようにタイプします。
uname -r
これで3.4.0-030400-genericと表示されれば新しいカーネルになったことを確認できます。
こうしたところ、私のThinkpad T430sは全くフリーズしなくなりました。カーネルの問題だったということですね。これで安心して解析ができます。
Ubuntuのキーボードセッティング
Ubuntuではキーボードのレイアウトを簡単に変えることはできますが、「システムデフォルト」はコマンドラインでしか変えられないようです。
変えたい時は以下をタイプすれば大丈夫です。
sudo dpkg-reconfigure keyboard-configuration
ちなみに、私はThinkapd 430sの英語キーボードを使っているので、Generic 101に変更しました。
TeX Live 2012 on Ubuntu 12.04
Windows 8.1を試しに使ってみたら、あまりにも不適応を起こしたので、この際、思い切ってメイン環境をLinuxに切り替えることにしました。
OSはXubuntu 12.04ベースのLin4Neuroです。自分が使いやすいようにカスタマイズしているので、一番自分にぴったりあっています。
Latexに関しては、TeX Live 2012を入れたいと思っていたのですが、検索したら、こちらのサイトに非常にわかりやすく解説されていました。やるべきことは下記のとおりです。
sudo apt-add-repository ppa:texlive-backports/ppa sudo apt-get update; sudo apt-get upgrade; sudo apt-get install texlive-lang-cjk
こんなに簡単にできるのは感動ものです。